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    Biolog方法用于環(huán)境微生物群落研究
    時(shí)間:2013-08-04 15:43 ??來源:未知 ??作者:肖遙 ??點(diǎn)擊:

     

     

      Biolog方法美國的BIOLOG公司于1989年開發(fā)成功,最初就根據(jù)其中具體類型的代謝指紋來鑒定已分離純化的環(huán)境微生物物種,至今已經(jīng)能夠鑒定包括細(xì)菌、酵母菌和霉菌在內(nèi)的2000多種病原微生物和環(huán)境微生物。1991年,Garland和Mills開始將這種方法應(yīng)用于土壤微生物群落的研究,該項(xiàng)工作引起了許多微生物生態(tài)學(xué)研究者的廣泛關(guān)注。測定原理:Biolog研究環(huán)境微生物的載體是微孔板(micro plate),每板包含96個(gè)孔,其中95個(gè)孔中加入了95種單一碳源和四唑染料,另外一個(gè)未加碳源的孔中加水為對照,環(huán)境微生物接種到微孔板上的孔中后,孔中的環(huán)境微生物就可能利用其中的碳源而發(fā)生氧化還原作用,而孔中一旦有電子轉(zhuǎn)移,這種四唑染料就會變?yōu)樽仙?,同時(shí)也表明這種碳源被接種到其中的環(huán)境微生物所利用。顏色的深淺可以反映環(huán)境微生物對碳源的利用程度。由于環(huán)境微生物對不同碳源的利用能力很大程度上取決于環(huán)境微生物的種類和固有性質(zhì),因此在一塊微平板上同時(shí)測定環(huán)境微生物對不同單一碳源的利用能力(sole carbon source utilization,SCSU),就可以鑒定純種環(huán)境微生物或比較分析不同的環(huán)境微生物群落。
      Biolog方法用于環(huán)境微生物群落研究,具有以下特點(diǎn):①靈敏度高,分辨力強(qiáng),對SCSU的測定可以得到被測環(huán)境微生物群落的代謝特征指紋(metabolic finger print),分辨環(huán)境微生物群落的微小變化;②無需分離培養(yǎng)純種環(huán)境微生物,可最大限度地保留環(huán)境微生物群落原有的代謝特征;③測定簡便,數(shù)據(jù)的讀取與記錄可以由計(jì)算機(jī)輔助完成,環(huán)境微生物對不同碳源代謝能力的測定在一塊微平板上一次完成,效率大大提高。
      Biolog 系統(tǒng)主要包括Biolog微平板、微平板讀數(shù)器和一套微機(jī)系統(tǒng),具體說明如下:
      Biolog系統(tǒng)組成與說明:
      Biolog微平板——共96孔,孔中含有營養(yǎng)液和四唑鹽染料TTC;其中1孔不含碳源,為對照孔,其他95孔含有不同單一碳源;
      讀數(shù)器——測定一定波長下每個(gè)小孔內(nèi)的吸光度及變化;
      微機(jī)系統(tǒng)——與讀數(shù)器相連,自動完成數(shù)據(jù)采集、傳輸、貯存與分析。
      Biolog方法操作的主要流程:
      步驟1,平板選擇:針對G+和G-細(xì)菌選擇不同平板(Biolog GP、Biolog GN),各孔內(nèi)碳源也可調(diào)控;
      步驟2,樣品制備:將微生物從環(huán)境介質(zhì)中提取出來,控制到適宜濃度(濁度表示);
      步驟3,加樣:取一定體積菌液(一般150μL/孔),平行加入各孔;
      步驟4,培育與讀數(shù):恒溫培育,用微平板讀數(shù)器記錄各孔吸光度值變化。


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